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प्लांट आण्विक जीवविज्ञान और जेनेटिक इंजीनियरिंग |
कुल क्रेडिट : ३
कुल व्याख्यानों की संख्या : ३६
कोर्स प्रभारी: डॉ. सुभ्रा चक्रवर्ती और डॉ. देबाशीष चट्टोपाध्याय |
| पाठ्यक्रम सामग्री |
- सेल चक्र और विकास
- बीज विकास
- फोटोमॉरफोजेनेसिस
- वयस्क पौधे: जड़, पत्ती और फूल
- प्रोटीन लक्ष्यीकरणः श्रेणीकरण, यातायातीकरण और ह्रास
- जीन क्लोनिंग : आगे और विपरीत आनुवांशिकी
- सेल संकेतन : जी-प्रोटीन, कैल्सियम ++/ कैल्सियम एम और एम ए पी के
- वंशाणु और जीन विनियमन: सामान्य आनुवांशिकी, एसआई आर एन ए, एपीजेनेटिक घटना और क्रोमाटिन रीमोडेलिंग
- आनुवांशिक अभियांत्रिकी और फसल सुधार
- पादप आनुवांशिक परिवर्तन
- एग्रोबक्टेरियम-मध्यस्थता परिवर्तन
- एग्रोनोमिक, औद्योगिक और गुणवत्ता लक्षण
- जैव सुरक्षा नियम और आईपीआर मुद्दे
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| प्लांट फिजियोलॉजी और जैव रसायन |
कुल क्रेडिट: ३
कुल व्याख्यानों की संख्या : ३६
कोर्स प्रभारी: डॉ. निरंजन चक्रवर्ती और डॉ. आलोक कृष्णा सिन्हा |
| पाठ्यक्रम सामग्री |
- पादप और सेल संरचना
- पादप सेल का परिचय और ओर्गानेल्लेस
- पादप केटोस्केलेटन: सूक्ष्मनलिकाएं और माइक्रोफिलामेंट्स
- अतिरिक्त कोशिकीय आव्यूह (मैट्रिक्स)
- पादप विकास, भिन्नता, और विकास
- हार्मोन और एलिसिटोर्स के जैव-संस्लेषण और चयापचय
- हार्मोन और विकास
- हार्मोन कार्यकलाप के आण्विक आधार
- सेल भिन्नता
- सेनेसेंस और सेल मृत्यु
- पादप माध्यमिक चयापचय
- माध्यमिक चयापचयों का जैव-संस्लेषण: टेर्पेनोइडस, एल्कलॉइड्स, फिनाइलप्रोपनोइड्स, और फ़्लवोनोइड्स
- माध्यमिक चयापचयों का उपापचयी अभियांत्रिकी
- शुगर संकेतन
- तनाव फिजियोलॉजी: मेजबान-रोगाणु सहभागिता
- कवक, जीवाणु, वायरस और निमेटोड
- तनाव फिजियोलॉजी: अजैव तनाव
- जल की कमी या सूखा और लवणता तनाव
- परासरणी समायोजन और उसकी सहनशीलता में सुखें और लवणता की भूमिका
- प्रकाश और तापमान तनाव
- तनाव जीन प्रेरित अभिव्यक्ति
- प्रकाश संस्लेषण और स्वसन
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| प्लांट जेनोमिक्स |
कुल क्रेडिट: ३
कुल व्याख्यानों की संख्या : ३६
पाठ्यक्रम प्रभारी: डॉ. सभ्यता भाटिया और डॉ. प्रवीण वर्मा |
| पाठ्यक्रम सामग्री |
- परिचय: जीन और जीनोम
- जीनोम संगठन
- परमाणु, माईटोकंड्रीयल और क्लोरोप्लास्ट जीनोम
- आण्विक मार्कर: अवलोकन
- परिभाषाएँ, गुण, आणविक मार्करों के प्रकार|
- आर ए पी डी और ए एफ एल.पी. एनालिसिस: डीएनए टाइपिंग में सिद्धांत, पद्धति, और अनुप्रयोग, वंशावली मूल्यांकन और कृषिजोपजाति पहचान, फयलोजेनेटिक्स
- विभिन्न आणविक मार्कर का उपयोग कर संपर्क मानचित्र का निर्माण: सिद्धांतों, मानचित्रण आबादी, पुनर्संयोजन भिन्न, एल ओ डी गणना , संपर्क समूहों की स्थापना, क्यू टी एल एनालिसिस
- पादप प्रजनन में मार्कर की सहायता के चयन की अवधारणा, एस सी ए आर
- माईक्रोसेटेलाईट्स, अवलोकन संकरण आधारित माइक्रोसेटेलाइट फिंगरप्रिंटिंग, माइक्रोसेटेलाइट अनुक्रमण के पृथक्करण के लिए रणनीतियाँ, एस टी एम एस मार्कर
- विभिन्न मार्कर प्रणालियों की तुलना
- अन्य मार्कर: एस ए एम पी एल, आर ए एम पी, सी ए पी एस, एस एन पीस आदि
- जीनोम एनालिसिस: जीनोमिक्स में प्रयुक्त प्रतिरूपण प्रणाली
- कोस्मिड्स, पी 1 जीवाणुभोजी, बीएसी और वाई ए सी प्रतिरूपण सदिश, उच्च आण्विक वजन वाले डीएनए का पृथक्करण और पी एफ जी ई द्वारा गुणसूत्रों का विभाजन, कंटिग एसेम्ब्ली, गुणसूत्र संचालन और मानचित्र आधारित प्रतिरूपण
- जीनोम एनालिसिस: जीनोम का भौतिक मानचित्रण
- परम्परागत सायटोजेनेटिक्स, प्रतिबंध संकरण विश्लेषण द्वारा भौतिक मानचित्रण, ऍफ़.आई.एस.एच और संबंधित तकनीक, गुणसूत्र चित्र और सूक्ष्म विच्छेदन, विस्तृत कार्यक्षेत्र का भौतिक मानचित्रण.
- जीनोम एनालिसिस: अनुक्रमण और जीनोम एनालिसिस
- जटिल जिनोमों के व्यवस्थित अनुक्रमण के लिए अनुक्रमण रणनीतियां, जीनोम अनुक्रम विश्लेषण, एनोटेशन और जीन का पूर्वानुमान
- क्रियात्मक जीनोमिक्स
- परिचय, जीनोम में क्रियात्मक जीन को खोजने के लिए रणनीतियाँ, जीन टैगिंग रणनीतियाँ और अनुप्रयोग, ई एस टीज़ और जीनोमिक्स में इसकी उपयोगिता, विभेदक जीन रूपरेखा विधियाँ, डीएनए चिप्स / माइक्रोएरेस
- प्लांट ट्रांस्पोसेबल एंड रेट्रो-ट्रांस्पोसेबल तत्व:
- परिचय, प्लांट ट्रांस्पोसेबल तत्वों के प्रकार, जीन की ट्रांसपोसोन टैगिंग, जीनोम विकास में भूमिका.
- प्रोटियोमिक्स
- प्रोटियोम विश्लेषण की रणनीतियाँ और अनुप्रयोग.
- विकासवादी जीनोमिक्स
- जीनोम विकास का परिचय, नए जीनों का अधिग्रहण, गैर कोडिंग क्षेत्रों का विकास, आण्विक फायलोजेनेटिक्स और अनुप्रयोग, जीनोम में बहुजीनीय परिवारों का विकास
- तुलनात्मक जीनोमिक्स
- परिचय, पौधों के तुलनात्मक जीनोमिक्स, अनाज और फली के तुलनात्मक जीनोमिक्स.
- एस ए जी ई और एस एन पीस एनालिसिस
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| प्लांट जीनोम का इन-सिलिको एनालिसिस |
कुल क्रेडिट: २
कुल व्याख्यानों की संख्या : २४
पाठ्यक्रम प्रभारी: डॉ. मनोज प्रसाद और डा. गीतांजलि यादव |
| पाठ्यक्रम सामग्री |
- परिचय: अनुक्रम से जीनोमिक्स युग के कार्य तक, विभिन्न पौधों के जीनोम डाटाबेस
- विभिन्न अनुक्रम प्रारूपों का परिचय, विभिन्न प्रकार के बी एल ए एस टी (ब्लास्ट) खोज और ऍनटरिज़
- जीनोम एनोटेशन के सिद्धांत, उपकरण और संसाधन
- विभिन्न अनुक्रम संरेखण और फायलोजेनेटिक्स एनालिसिस
- जीन मानचित्रण, मानचित्र बनाने के उपकरण और संसाधन
- पेप्टाइड बॉण्ड, प्रोटीन रूपांकन, डोमेन्स और लचीलापन, माध्यमिक संरचना का महत्व, अन्तर आणविक अंतरफलक
- पी डी बी संरचना फ़ाइलों की व्याख्या, प्रोटीन कार्यो के संरचनात्मक आधार, बाइंडिंग साइट्स के स्थान और प्रकृति
- अनुक्रम से संरचना: माध्यमिक संरचना का पूर्वानुमान, तुलनात्मक एवं अनुरूपता मॉडलिंग, रूपरेखा आधारित सूत्रण विधियाँ, रोसेट्टा और छुपे हुए मार्कोव मॉडल
- संरचना से कार्य: प्रोटीन उत्कृष्ट परिवार, बाइंडिंग साइट्स की पहचान, उत्प्रेरक अवशेष की पहचान
- प्रोटीन से प्रोटीन सहभागिता: जैव आणविक कॉम्प्लेक्सस का पूर्वानुमान अभिग्राहक-लिगेंड समानता और मॉडलिंग संरचनाओं के लिए एल्गोरिथम डॉकिंग
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| Instrumentation |
Total Credit(s) : 1
Total Number of Lectures : ____________
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| Course Material |
- Proteomics.
- Radioisotope and imaging.
- Confocal microscopy.
- Sequencing, real-time PCR and pulse-field gel electrophoresis.
- Microarry.
- LAN & Computational Facility.
- Chromatography.
- Gene gun.
- Photometry.
- Mapping Techniques.
- General Instrumentation.
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